Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gapvd1Q6PAR5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms