Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtminQ6P9S1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms