Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms