Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms