Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms