Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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