Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms