Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms