Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScxQ64124 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms