Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms