Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CochQ62507 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CochQ62507 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CochQ62507 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CochQ62507 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CochQ62507 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CochQ62507 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CochQ62507 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CochQ62507 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms