Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrhQ62361 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms