Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms