Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pacsin1Q61644 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms