Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irf9Q61179 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf9Q61179 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms