Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms