Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd6Q61003 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms