Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd4Q60688 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms