Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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