Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms