Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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