Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms