Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shank3Q4ACU6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shank3Q4ACU6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms