Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms