Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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