Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxred2Q3USW5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms