Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem253Q3UNB8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms