Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms