Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms