Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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