Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms