Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U595 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U595 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q3U595 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U595 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms