Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pank2Q3U4S0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pank2Q3U4S0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms