Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
InipQ3TXT3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms