Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd4Q3TT99 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms