Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms