Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca4Q3TKT4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms