Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Trappc13Q3TIR1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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