Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc69Q3TCJ8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms