Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms