Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms