Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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