Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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