Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms