Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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