Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms