Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn2bQ0KL01 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms