Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms