Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms