Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms